LC/MSを用いた合成オリゴDNAの高感度分析 (VN-50 1DとVN-50 2Dの比較)

HILICpak VN-50 1DとVN-50 2Dを用いて合成オリゴDNAの19merと20merのLC/MS測定を行いました。内径1.0 mmのVN-50 1Dは流量を0.1 mL/min以下に抑えられるためLC/MSの感度が向上します。本条件ではイオンペア試薬が不要で、また、高濃度の塩を移動相に添加する必要もありません。簡便な移動相条件でオリゴ核酸の分離分析を行うことが可能です。

Sample: 0.4 µL
0.05 mg/mL each (in H2O/CH3CN=50/50)

  1. 1.Synthesized oligo-DNA 19mer(crude)
    TTCTCATGGTTCTTCGGAA
  2. 2.Synthesized oligo-DNA 20mer(crude)
    CTTCTCATGGTTCTTCGGAA
Chromatogram of Synthesized oligo-DNA
Column
Shodex HILICpak VN-50 1D (1.0 mm I.D. x 150 mm)
Shodex HILICpak VN-50 2D (2.0 mm I.D. x 150 mm)
Eluent
(A);50 mM HCOONH4 aq. /(B); CH3CN
Linear gradient ;
(B %) 65 to 50 % (0 to 20 min), 50 to 65 % (20 to 20.01 min), 65 % (20.01 to 25 min)
Flow rate
0.1 mL/min (VN-50 1D)
0.3 mL/min (VN-50 2D)
Detector
ESI-MS (SIM Negative)
Column temp.
40 ℃

試料名インデックス

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製品名インデックス

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