使用HILICpak VN-50 2D对合成的寡脱氧核苷酸62mer的未纯化产物进行HPLC分析。在此分析条件下，样品以聚合度由低到高的顺序洗脱，可以分离至约30mer的低聚核酸。通常，在核酸分析中经常使用离子对反相模式和离子交换模式，但是存在离子对试剂在设备中残留的问题，并且离子交换模式需要高浓度的盐用于洗脱，因此这些分析条件难以应用于MS检测。使用VN-50 2D进行分析，不需要添加离子对试剂，也无需向流动相中添加高浓度的盐。可以在简单的流动相条件下进行寡核苷酸的分离。



Sample : 1 µL
Synthesized oligo-DNA 62mer (crude) 2.8 mg/mL (in H₂O)
CATGAGAAGTATGACAACAGCCCCACACCGGCTGTTGTCATACTTCTCATGGTTCTTCGGAA

Column       : Shodex HILICpak VN-50 2D (2.0 mm I.D. x 150 mm)
Eluent       : (A); 50 mM HCOONH4 aq./(B); CH3CN
               Linear gradient ;
               (B %) 60 % (0 to 10min), 60 % to 50 % (10 to 25min), 60 % (25.01 to 30min)
Flow rate    : 0.2 mL/min
Detector     : UV (260 nm) (small cell volume)
Column temp. : 40 ℃