使用LC/MS进行合成寡DNA的高灵敏度分析 (VN-50 1D和VN-50 2D的比较)

使用HILICpak VN-50 1D和VN-50 2D进行合成寡DNA 19mer、20mer的LC/MS分析。VN-50 1D的内径为1.0 mm,可将流速控制在0.1 mL/min以下,提高LC/MS的灵敏度。本实验不需要使用离子对试剂,也不需要在流动相中添加高浓度的盐。可以利用简单的分析条件进行寡核酸的分离

Sample: 0.4 µL
0.05 mg/mL each (in H2O/CH3CN=50/50)

  1. 1.Synthesized oligo-DNA 19mer(crude)
    TTCTCATGGTTCTTCGGAA
  2. 2.Synthesized oligo-DNA 20mer(crude)
    CTTCTCATGGTTCTTCGGAA
Chromatogram of Synthesized oligo-DNA
Column
Shodex HILICpak VN-50 1D (1.0 mm I.D. x 150 mm)
Shodex HILICpak VN-50 2D (2.0 mm I.D. x 150 mm)
Eluent
(A);50 mM HCOONH4 aq. /(B); CH3CN
Linear gradient ;
(B %) 65 to 50 % (0 to 20 min), 50 to 65 % (20 to 20.01 min), 65 % (20.01 to 25 min)
Flow rate
0.1 mL/min (VN-50 1D)
0.3 mL/min (VN-50 2D)
Detector
ESI-MS (SIM Negative)
Column temp.
40 ℃

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