核酸作为备受期待的下一代医药品，在开发和质量控制中，原先分析寡核苷酸使用较多的方法是利用添加离子对试剂的反相模式以及离子交换模式。然而添加离子对试剂容易造成在设备中残留的问题。以下是使用聚合物基质HILIC色谱柱HILICpak VN-50 2D分析未精制的硫代磷酸酯寡聚脱氧核糖核酸20聚体。硫代磷酸酯化的寡核苷酸具有更好的稳定性。比普通的核酸更常用于核酸药物，本实验方法使用HILIC模式，不需要添加离子对试剂，使用50 mM甲酸铵水溶液（pH9.5）和乙腈梯度洗脱，可以良好分离低聚物。


Sample : 1 µL
Synthesized phosphothioated oligo-DNA 20mer (crude)
(A*T*A*C*C*G*A*T*T*A*A*G*C*G*A*A*G*T*T*T ; * means phosphorothioated position)
1.0 mg/mL (in H₂O)

Column       : Shodex HILICpak VN-50 2D (2.0 mm I.D. x 150 mm)
Eluent       : (A)50 mM HCOONH4 aq. (pH9.5)/(B) CH3CN
               Linear gradient ;
               (B %) 64 to 58 % (0 to 10 min), 58 % (10 to 15 min), 
                    58 to 64 % (15 to 15.01 min), 64 % (15.01 to 20 min)
Flow rate    : 0.25 mL/min
Detector     : UV (260 nm) (small cell volume)
Column temp. : 40 ℃