由于氨基糖苷类抗生素亲水性很高，分子内有4个以上氨基，所以用反相模式进行分离是必须使用离子对试剂。而且，由于这些物质无紫外吸收，所以使用LC/MS更为有效。以下是使用聚合物基质HILIC模式色谱柱HILICpak VC-50 2D利用阳离子交换模式进行各种氨基糖苷类抗生素的LC/MS分析。流动相中添加氨成为碱性条件可以抑制分子内氨基的分解，弱化离子交换作用从而得到分析。


Sample : Aminoglycoside antibiotics 0.1 µg/mL (in H₂O), 20 μL
Kanamycin sulfate
Tobramycin sulfate
Gentamicin sulfate
Neomycin sulfate
Amikacin dihydrate

Column       : Shodex HILICpak VC-50 2D (2.0 mm I.D. x 150 mm)
Eluent       : (A); 1.5 % NH3 aq./(B); CH3CN 
               High pressure linear gradient ;
               (B %) 30 % to 10 % (0 to 5 min), 10 % (5 to 15 min)
Flow rate    : 0.3 mL/min
Detector     : ESI-MS SIM
Column temp. : 40 ℃