HILICpak VN-50 2Dを用いて合成オリゴDNA 10mer、20mer、30mer、40mer、50merについてHPLC測定を行いました。この分析条件ではオリゴDNAは重合度の低い順に溶出します。グラジエント条件を変更することで鎖長の長いオリゴDNAの分離が向上することを確認した。本条件では、イオンペア試薬が不要であり、また高濃度の塩を移動相に添加する必要もありません。簡便な移動相条件でオリゴ核酸の分離分析を行っていただくことができます。
Sample : 0.02 mg/mL each (in H2O), 1 μL
1. Synthesized oligo-DNA 10mer(crude),
TTCTTCGGAA
2. Synthesized oligo-DNA 20mer(crude),
CTTCTCATGGTTCTTCGGAA
3. Synthesized oligo-DNA 30mer(crude),
TGTTGTCATACTTCTCATGGTTCTTCGGAA
4. Synthesized oligo-DNA 40mer(crude),
CCACACCGGCTGTTGTCATACTTCTCATGGTTCTTCGGAA
5. Synthesized oligo-DNA 50mer(crude),
GACAACAGCCCCACACCGGCTGTTGTCATACTTCTCATGGTTCTTCGGAA
Column : Shodex HILICpak VN-50 2D (2.0 mm I.D. x 150 mm) Eluent : (A)50 mM HCOONH4 aq. (pH9.8)/(B) CH3CN Linear gradient ; (a) 60 % B (0 min) to 50 % B (10 to 20 min) to 60 % B (20.01 to 25 min) (b) 65 % B (0 min) to 45 % B (10 to 20 min) to 65 % B (20.01 to 25 min) Flow rate : 0.2 mL/min Detector : UV (260 nm) (small cell volume) Column temp. : 40 ℃